1994年以来 ，先后有美国、德国、英国、加拿大、斯洛文尼亚和台湾、香港等国家和地区的20余名教授学者来访，其中8名被聘为客座教授。国内有6名院士、20余名教授学者来本所访问讲学，其中有8名被聘为兼职教授。 先后与美国新英格兰生物实验室、德国明斯特大学、德国凯撒斯劳藤大学、澳大利亚阿德雷德大学、斯洛文尼亚芦布尔雅那大学、瑞典乌普萨拉大学、清华大学、上海交通大学、北京农业大学、青岛海洋大学、中科院上海生化与细胞所、中科院上海生命科学研究院、中科院武汉水生所等开展了多种形式的合作研究。先后参加国际性学术会议20余人次，全国学术研讨会50余人次，举办全国性学术会议3次。

    良好的对外合作交流促进了本所对国内外最新研究动态的及时了解和掌握，保证了我们的科研工作始终紧跟国际前沿领域。